劇情介紹
關島外海傳來有美國原子能潛水艇失去聯絡，日本政府派出兩艘「薩摩」號前往現場調查，途中，其中一艘被突如其來的巨大物體撞毀，廣瀨中佐在另一艘艇上看見有一隻有巨大背鰭的生物在事發地點附近出沒。

會議上，廣瀨認為這生物是50年前襲擊東京的哥斯拉，但三雲中將認為已過了50年，軍力強化了很多，輕視酷斯拉的威脅，50年前因酷斯拉來襲而失去雙親的立花准將心中感到不安……

孫子之手島在颱風夜中被不明物體侵襲，房屋及其他建築物被完全破壞，搜索隊的飛機到達現場時，只聽見一聲怪獸叫聲後便失去聯絡，官房長官終向大眾宣佈真實，襲擊美國原子能潛水艇及襲擊孫子之手島的生物是酷斯拉，政府並派出軍隊搜尋酷斯拉的行蹤…