劇情介紹
一年前與哥吉拉(Godzilla)的決戰, 機龍(機械哥吉拉Mechagodzilla)受損程度37%, 失去了右腕及終極武器-絕對零度炮.


維修組員中條義人在八王子基地負責修復機龍的工作. 某日中條在他叔叔信一的別墅家渡假時, 嬰兒島的小美人精靈竟然出現在他們眼前. 小美人給他們一個忠告: 人類用哥吉拉骸骨製造出機龍是個嚴重的錯誤, 如果出動機龍, 摩斯拉就會變成人類的敵人. 於是信一設法說服老友也是身為總理大臣的五十嵐, 希望能中止機龍的計劃. 但就在此時, 太平洋又出現哥吉拉的影蹤......

2004年是哥吉拉登上大銀幕的50週年. 上一部作品 “哥吉拉X機械哥吉拉”中, 以1954年第一代哥吉拉的骨骸做成的機龍首次登場, 與哥吉拉展開熾熱的戰鬥.

在這次, 哥吉拉同類的戰爭終於接近尾聲. 關鍵就在曾經襲擊過東京的摩斯拉與嬰兒島的小美人. 一直守護著摩斯拉與小美人的語言學者中條信一, 將這個任務交棒給他在機龍維修隊任職的外甥義人, 或許能感受到哥吉拉系列電影的歷史承傳吧!